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Table 3 Results of chromosome 13 array CGH analysis of 39 CLL patients

From: Monoallelic and biallelic deletions of 13q14 in a group of CLL/SLL patients investigated by CGH Haematological Cancer and SNP array (8x60K)

Case No.

Position of 13q14 deletion

Size of deletion

miR 15a/16-1 deletion

RB1 deletion

 

Monoallelic

5.

arr 13q14.2q14.3

(50,561,374-50,909,490)x1

348,12 Kb

+

-

18.

arr 13q14.2q14.3

(50,575,469-51,213,898)x1

638,43 Kb

+

-

14.

arr 13q14.2q14.3

(50,648,212-51,296,645)x1

648.43Kb

-

-

10.

arr 13q14.2q14.3

(50,532,206-51,502,524)x1

970,32 Kb

+

-

11.

arr 13q14.2q14.3

(50,506,929-51,502,525)x1

995,60 Kb

+

-

17.

arr 13q14.2q14.3

(49,975,238-51,581,258)x1

1,61 Mb

+

-

6.

arr 13q14.2q14.3

(50,547,426-52,293,661)x1

1.75 Mb

+

-

19.

arr 13q14.2q14.3

(49,667,023-51,766,748)x1

2,10 Mb

+

-

21.

arr 13q14.2q14.3

(49,466,784-51,789,968)x1

2,32 Mb

+

-

1.

arr 13q14.2q14.3

(48,796,715-51,126,898)x1

2,33 Mb

+

-

4.

arr 13q14.2q14.3

(49,643,767-52,415,185)x1

2,77 Mb

+

-

20.

arr 13q14.2q14.3

(48,852,953-52,024,641)x1

3,17 Mb

+

-

9.

arr 13q14.2q14.3

(48,476,853-51,937,417)x1

3,46 Mb

+

+

3.

arr 13q14.2q14.3

(48,229,933-51,827,408)x1

3,60 Mb

+

+

8.

arr 13q14.2q14.3

(48,875,709-52,722,490)x1

3,85 Mb

+

+

16.

arr 13q14.13q14.3

(47,067,473-52,293,661)x1

5,23 Mb

+

+

7.

arr 13q14.11q14.3

(44,820,708-51,472,821)x1

6.65 Mb

+

+

12.

arr 13q14.12q21.31

(45,230,434-65,085,253)x1

19,85 Mb

+

+

15.

arr 13q13.3q21.2

(37,178,772-60,025,895)x1

22,85 Mb

+

+

2.

arr 13q13.3q21.33

(39,377,596-71,248,873)x1

31,87 Mb

+

+

13.

arr 13q13.3q21.33

(36,430,114-71,248,873)x1

34,82 Mb

+

+

 

Biallelic

 

33.

arr13q14.2q14.3

(50,659,348-51,164,513)x0

505,17Kb

-

-

arr 13q14.2q14.3

(50,337,728-51,897,968)x0

1,56 Mb

+

-

38.

arr 13q14.2q14.3

(50,575,469-51,360,705)x0

785,24 Kb

+

-

25.

arr 13q14.2q14.3

(50,597,418-51,454,330)x0

856.91Kb

+

-

27.

arr 13q14.2q14.3

(50,575,469-51,441,414)x1

865,95 Kb

+

-

24.

arr 13q14.2q14.3

(50,561,374-51,441,414)x0

880,04 Kb

+

-

26.

arr 13q14.2q14.3

(50,575,469-51,472,821)x0

897,35 Kb

+

-

35.

arr 13q14.2q14.3

(50,575,469-51,502,524)x1

927,06 Kb

+

-

arr 13q14.2q14.3

(48,754,460-52,536,626)x1

3,78 Mb

+

+

29.

arr 13q14.2q14.3

(50,575,469-51,523,591)x1

948,12 Kb

+

-

37.

arr 13q14.2q14.3

(50,532,206-51,502,524)x1

970,32 Kb

+

-

28.

arr 13q14.2q14.3

(50,484,540-51,524,424)x1

1,04 Mb

+

-

arr 13q14.2q14.3

(50,241,416-51,524,424)x1

1,28 Mb

+

-

34.

arr 13q14.2q14.3

(50,484,540-51,572,737)x1

1.09 Mb

+

-

32.

arr 13q14.2q14.3

(50,408,714-51,572,737)x0

1,16 Mb

+

-

arr 13q13.3q14.3

(39,596,989-51,624,965)x1

12,03 Mb

+

+

31.

arr 13q14.2q14.3

(50,305,714-51,469,354)x1

1,16 Mb

+

-

arr 13q12.3q21.31

(31,346,665-64,680,548)x1

33,33 Mb

+

+

36.

arr 13q14.2q14.3

(49,579,386-51,404,793)x1

1,83 Mb

+

-

40.

arr 13q14.2q14.3

(49,667,023-51,641,879)x1

1,97 Mb

+

-

arr 13q14.2q14.3

(48,783,721-52,722,490)x1

3,94 Mb

+

+

22.

arr 13q14.2q14.3

(48,841,955-50,976,908)x0

2,13 Mb

+

+

arr 13q14.13q14.3

(46,934,009-52,663,754)x0

5,73 Mb

+

+

30.

arr13q14.2q14.3

(48,801,028-51,680,357)x0

2,88 Mb

+

+

39.

arr 13q14.11q31.1

(41,246,428-80,220,989)x1

38.97 Mb

+

+

  1. In biallelic 13q14 deletion group digit x1 suggests monoallelic change, but this value is associated with lower percentage of cells with biallelic deletion in whole cell population